A PTE KK Sebészeti Klinika a dunántúli régió legmagasabb szintű sebészeti ellátóhelye. Több mint négyezer fekvő-, és harmincezer fő körüli ambuláns betegforgalmat bonyolít évente. A sebészeti szakma minden profiljával rendelkezik: általános sebészet, mellkassebészet, plasztikai- és égéssebészet, valamint transzplantációs sebészet áll rendelkezésre gyakorlott specialistákkal. Az általános sebészeten belül is kiemelt területük a minimálisan invazív sebészet, az emlősebészet, a gyomor-és nyelőcsősebészet, az epeúti és májsebészet, az endokrinológiai sebészet és a hasnyálmirigy sebészet. Országosan is jelentős az élődonoros vese-átültetési tevékenysége. A plasztikai és égéssebészeti tevékenysége országos feladatokat is ellát, összetett rekonstrukciós eljárásokat végezve. Mellkassebészeti beavatkozásai döntő többségükben minimálisan invazív technikákkal történnek. A klinikán üzemelő többszakmás DaVinci sebészeti robot, a hasi és mellkassebészet területén lát el betegeket. A sebészi társ szakmákkal együttműködve, összetett megoldásokat kívánó elváltozások ellátását is sikeresen végzik. A felsorolt fekvőbeteg ellátást támogató szakambulanciákon kívül, a stomával élők problémáival foglalkozó járóbeteg rendelés is elérhető. A betegek gyorsabb felépülését az adott esetben már a műtétek előtt elkezdett és utána folytatott, gyógytornász és dietetikus részvételével zajló kiegészítő kezelések segítik.