Pathológiai Intézet

Laboratóriumunk rosszindulatú daganatokban megjelenő kromoszómális eltéréseket azonosít konvencionális és molekuláris citogenetikai módszerekkel. A beérkező csontvelő, perifériás vér, nyirokcsomó, liquor, ascites és egyéb szövetminták döntő többségét onkohematológiai betegségek kapcsán vizsgáljuk. G-sávozást követő kariotipizálással jellemezni tudjuk az osztódó sejtek teljes kromoszóma készletét számbeli-, illetve a legalább 5-10 Mb hosszúságú genomikus tartományt érintő, szerkezeti aberrációk felderítésével. A hagyományos citogenetikai analízissel nem detektálható, kriptikus eltéréseket célzott fluoreszcens in situ hibridizációs (FISH) technikával szűrjük, mely nem igényel sejttenyésztést, így gyakorlatilag bármely citológiai-, illetve hisztológiai minta vizsgálatára alkalmas. Ezt a módszert jelenleg a klinikai szempontból egyértelműen indokolt esetekben, terápia releváns aberrációk azonosítására használjuk. Nehezen értékelhető, többszörös átrendeződéseket mutató kariotípus feltérképezéséhez metafázis preparátumokon is végzünk FISH analízist.

A klinikai diagnosztikai tevékenységet a Pécsi Tudományegyetemen kívül dél-dunántúli túlsúllyal több régióra kiterjedően végzünk. A hemato-onkológia mellett tüdőrák, emlőrák, neuroblasztóma, különböző szarkómák, valamint vesesejtes rák kapcsán végzünk FISH vizsgálatokat.

Kutatás

Az interfázis-FISH az onkopatológiai diagnosztika hatékony eszköze. A preparátumok értékelését manapság a legtöbb laboratórium manuálisan végzi, ennek kapcsán azonban felmerül néhány nem elhanyagolható probléma: (i) alacsony pozitivitás esetén a statisztikai megbízhatóság érdekében nagyszámú sejtmag vizsgálatára van szükség, mely azonban időigényes folyamat; (ii) az értékelő elfogultsága a pozitivitás alul- vagy felülbecsléséhez vezethet, különösen akkor, ha a pozitív sejtek aránya nagyon alacsony, vagy kiemelkedően magas; (iii) az értékelők és a laboratóriumok közötti variabilitás kérdésessé teszi az eredmények összehasonlíthatóságát; (iv) a transzlokációk vizsgálatakor döntő jelentőséggel bíró fúziós (kolokalizált) szignálnak nincsen egyértelmű, objektív definíciója. E nehézségek áthidalhatók motorizált mikroszkópia és digitális képanalízis alkalmazásával.

Az elmúlt években a következő 3D automatizált jelmintázat értékelő eljárásokat dolgoztuk ki: (i) genotípus vizsgálat citológiai preparátumon (BCR/ABL1 juxtapozíció kimutatása krónikus mieloid leukémiában); (ii) kombinált fluoreszcens feno- és genotipizálás citológiai preparátumon minimális reziduális betegség kimutatásához (CD10 immunjelölést követően ETV6/RUNX1 fúzió kimutatása gyermekkori akut limfoblasztos leukémiában); (iii) kombinált fénymikroszkópos immunfenotipizálás és négymarkeres molekuláris citogenetikai analízis lenyomati készítményen (CK7 kromogén immunfestést követő UroVysion vizsgálat hólyagtumorokban); (iv) genotípusos jellemzés hisztológiai környezetben (IGH/CCND1 és IGH/BCL-2 transzlokációk felderítése köpenysejtes -, illetve follikuláris limfómában). Úgy gondoljuk, hogy az általunk beállított módszerek hozzájárulnak a patológiai diagnosztika modernizálásához, ezért a jövőben bővíteni szeretnénk automatizált interfázis citogenetikai potenciálunkat és kapacitásunkat.

 

 

Publikációk

T. Tornóczky, E. Kálmán, Z. Sápi, Z. Orosz, L. Pajor: Cytogenetic abnormalities of alveolar soft-part sarcomas using interphase fluorescent in situ hybridization: trisomy for chromosome 7 and monosomy for chromosomes 8 and 18 seem to be characteristic of the tumor. Virchows Arch. 2001 Feb;438(2):173-80.

Tamás Tornóczky, Endre Kálmán, Pál G Kajtár, Tibor Nyári, Andrew D J Pearson, Deborah A Tweddle, Julian Board, Hiroyuki Shimada: Large cell neuroblastoma: a distinct phenotype of neuroblastoma with aggressive clinical behavior. Cancer. 2004 Jan 15;100(2):390-7.

Kajtár B, Méhes G, Lörch T, Deák L, Kneifné M, Alpár D, and Pajor L: Automated Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) Analysis of t(9;22)(q34;q11) in Interphase Nuclei. Cytometry Part A, 2006 Jun;69(6):506-14.

Alpár D, Kajtár B, Kneif M, Jáksó P, László R, Kereskai L, Pajor L: Automated detection of residual leukemic cells by consecutive immunolabeling for CD10 and FISH for ETV6/RUNX1 rearrangement in childhood acute lymphoblastic leukemia. Cancer Genetics and Cytogenetics, 2007 Feb;173(1):23-30.

Pajor G, Süle N, Alpár D, Kajtár B, Kneif M, Bollmann D, Somogyi L, Pajor L: Increased efficiency of detecting genetically aberrant cells by UroVysion test on voided urine specimens using automated immunophenotypical pre-selection of uroepithelial cells. Cytometry Part A, 2008 Mar;73A(3):259-65.

Alpár D, Hermesz J, László R, Kereskai L, Jáksó P, Pajor G, Pajor L, Kajtár B: Automated FISH analysis using dual-fusion and break-apart probes on paraffin-embedded tissue sections. Cytometry Part A, 2008 Jul;73(A):651-57.

László R, Alpár D, Kajtár B, Lacza Á, Ottóffy G, Kiss Cs, Bartyik K, Nagy K, Pajor L. Detection of early precursors of t(12;21) positive pediatric acute lymphoblastic leukemia during follow-up. Pediatric Blood and Cancer, 2010 Jan;54(1):158-60.

Alpár D, Nagy G, Hohoff C, Kajtár B, Bartyik K, Hermesz J, Jáksó P, Andrikovics H, Kereskai L, Pajor L. Sex chromosome changes after sex-mismatched allogeneic bone marrow transplantation can mislead the chimerism analysis. Pediatric Blood and Cancer, 2010 Dec;55:1239-42. 

Alpár D, Kereskai L. Three-step cytogenetic evolution in paediatric acute lymphoblastic leukaemia with t(12;21). BloodMed, 2010 Dec; 251.

Alpár D. Recurrent disease or donor cell leukemia? Brain teaser after allogeneic bone marrow transplantation. Chimerism, 2011 Jan;2(1):19-20.

Nagy Z, Kajtár B, Jáksó P, Dávid M, Kosztolányi S, Hermesz J, Kereskai L, Pajor L, Alpár D. Evolutionary sequence of cytogenetic aberrations during the oncogenesis of plasma cell disorders. Direct evidence at single cell level. Leukemia Research, 2011 Aug;35(8):1114-6.

Pajor G, Somogyi L, Melegh B, Alpár D, Kajtár B, Farkas L, Kneif M, Bollmann D, Pajor L, Süle N. Urovysion: considerations on modifying current evaluation scheme, including immunophenotypic targeting and locally set statistically derived diagnostic criteria. Cytometry Part A, 2011 May;79(5):375-82.

Tamás Tornóczky, Barna Bogner, Thomas Krausz, Gábor Ottóffy, Károly Szuhai: Angiomatoid fibrous histiocytoma: pleomorphic variant associated with multiplication of EWSR1-CREB1 fusion gene. Pathol Oncol Res. 2012 Apr;18(2):545-8.

Pajor G, Alpár D, Kajtár B, Melegh B, Somogyi L, Kneif M, Bollmann D, Süle N, Pajor L. Automated signal pattern evaluation of a bladder cancer specific multiprobe-FISH assay applying a user-trainable workstation. Microscopy Research and Technique, 2012 Jun;75(6):814-20.

Alpár D, de Jong D, Savola S, Yigittop H, Kajtár B, Kereskai L, Pajor L, Szuhai K. MLPA is a powerful tool for detecting lymphoblastic transformation in chronic myeloid leukemia and revealing the clonal origin of relapse in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Cancer Genet. 2012 Sep;205(9):465-9.

Pajor G, Kajtár B, Pajor L, Alpár D. State-of-the-art FISHing: automated analysis of cytogenetic aberrations in interphase nuclei. Review. Cytometry A. 2012 Aug;81(8):649-63.

Haltrich I, Csóka M, Kovács G, Török D, Alpár D, Ottoffy G, Fekete G. Six cases of rare gene amplifications and multiple copy of fusion gene in childhood acute lymphoblastic leukemia. Pathol Oncol Res. 2013 Jan;19(1):123-8.

Alpar D, de Jong D, Holczer-Nagy Z, Kajtar B, Savola S, Jakso P, David M, Kosztolanyi S, Kereskai L, Pajor L, Szuhai K. Multiplex ligation-dependent probe amplification and fluorescence in situ hybridization are complementary techniques to detect cytogenetic abnormalities in multiple myeloma. Genes Chromosomes Cancer. 2013 Sep;52(9):785-93.

Kajtár B, Tornóczky T, Kálmán E, Kuzsner J, Hogendoorn PC, Szuhai K. CD99-positive undifferentiated round cell sarcoma diagnosed on fine needle aspiration cytology, later found to harbour a CIC-DUX4 translocation: a recently described entity. Cytopathology. 2014 Apr;25(2):129-32.

Semjen D, Kalman E, Tornoczky T, Szuhai K.: Further evidence of the existence of benign teratomas of the postpubertal testis. Am J Surg Pathol. 2014 Apr;38(4):580-1.

Alpár D, Pajor G, Varga P, Kajtár B, Pótó L, Mátics R, Vojcek A, Ottoffy G, Szuhai K, Pajor L. Sequential and hierarchical chromosomal changes and chromosome instability are distinct features of high hyperdiploid pediatric acute lymphoblastic leukemia. Pediatr Blood Cancer. 2014 Dec;61(12):2208-14.

Smuk G, Tornóczky T, Pajor L, Chudoba I, Kajtár B, Sárosi V, Pajor G. Immense random colocalization, revealed by automated high content image cytometry, seriously questions FISH as gold standard for detecting EML4-ALK fusion. Cytometry A. 2018 Jun;93(6):653-661.

Kosztolányi S, Kiss R, Atanesyan L, Gángó A, de Groot K, Steenkamer M, Jáksó P, Matolcsy A, Kajtár B, Pajor L, Szuhai K, Savola S, Bödör C, Alpár D. High-Throughput Copy Number Profiling by Digital Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification in Multiple Myeloma. J Mol Diagn. 2018 Nov;20(6):777-788.

Kosztolányi S, Horváth B, Hosnyánszki D, Kereskai L, Sziládi E, Jáksó P, Alizadeh H, Szuhai K, Alpár D, Kajtár B. [Molecular cytogenetic analyses of patients with plasma cell myeloma in Tolna and Baranya counties in Hungary]. Orv Hetil. 2019 Jun;160(24):944-951.

Gábor Smuk, Gábor Pajor, Károly Szuhai, Hans Morreau, Ildikó Kocsmár, Éva Kocsmár, László Pajor, Béla Kajtár, Veronika Sárosi, Gábor Lotz, Tamás Tornóczky: Attenuated isolated 3' signal: A highly challenging therapy relevant ALK FISH pattern in NSCLC. Lung Cancer. 2020 May;143:80-85.

Dávid Semjén, Krisztina Bíró, Emese Kapitány, Endre Kálmán, Tamás Tornóczky, Béla Kajtár: Histology, 12p status, and IMP3 expression separate subtypes in testicular teratomas. Virchows Arch. 2020 Jul;477(1):103-110.

 

Oktatás

A laboratórium részt vesz a "Molekuláris pathologia a modern orvostudományban: diagnosztikus, prediktív és terápia asszociált vizsgálatok" című PhD kurzusok oktatásában, valamint az orvosdiagnosztikai laboratóriumi analitikus, illetve a laboratóriumi kutatói képzésekben.

Munkatársak

Dr. Kajtár Béla, PhD
egyetemi adjunktus
+36-72-536-000/31845
e-mail: kajtar.bela@pte.hu

Horváth Bálint
biológus
+36/72-536-001/31505

Hosnyánszki Diána
biológus
+36/72-536-001/31505

Takács Viktória

biológus
+36/72-536-001/31505

Sepsei Ivett, BSc
orvosdiagnosztikai laboratóriumi analitikus
+36-72-536-000/31505

 

Hasznos linkek

http://atlasgeneticsoncology.org/
http://cgap.nci.nih.gov/Chromosomes/Mitelman